MTs Terpadu Alam Jamur memiliki ekstrakurikuler wajib dan pilihan sesuai minat dan bakat siswa, sebagai berikut:
Ekstrakurikuler wajib:
- Pramuka
Ekstrakurikuler Pilihan
- Math Club
- English Club
- Science Club
- Tahfidz
- Karya Tulis Ilmiah Remaja
- Badminton
- Futsal
- Hadrah
- Video Editing